La producción científica sufre actualmente de una falta de reproducibilidad (la capacidad de recrear un estudio con base en la información publicada), producto de la escasa documentación de los métodos y análisis utilizados, así como de la falta de acceso a los datos generados. La biología no ha escapado de esta crisis de reproducibilidad científica, que afecta la credibilidad de nuestra comunidad. Por suerte, en respuesta a esta crisis se ha desarrollado una multitud de herramientas, en la mayoría de los casos libremente disponibles, para aumentar la transparencia y accesibilidad de datos que respaldan las conclusiones de los estudios científicos. El poder hacer llegar estas herramientas a la comunidad científica y fomentar su uso de forma temprana en la formación de los investigadores resulta fundamental para solventar la crisis de reproducibilidad. Estas herramientas giran alrededor de tres ejes principales: 1) repositorios en linea para compartir datos y productos de la investigación, 2) herramientas digitales de libre acceso y 3) la implementación de buenas pŕacticas de manejo y análisis de datos. Estos tres ejes representan los módulos en que se organiza el curso. Este curso pretende profundizar en el uso de herramientas (en su mayoría digitales) así como de buenas prácticas a lo largo de cada uno de las etapas comunes al desarrollo de proyectos de investigación en biología.
Objetivos
- Dar a conocer la problemática actual sobre reproducibilidad científica y sus implicaciones para la producción de conocimiento y la legitimidad de este en la sociedad
- Brindar a los estudiantes herramientas computacionales de software libre que faciliten la documentación y accesibilidad de la investigación
- Identificar procesos en las diferentes etapas de la investigación científica en las que se pueden adoptar prácticas que facilitan la reproducibilidad
- Proveer a los estudiantes con experiencia en la aplicación de las herramientas brindadas por medio de prácticas y proyectos individuales
Dinámica de las clases
- Pueden hacer preguntas en cualquier momento
- Sientanse libres de responder preguntas de compañeros
- Traten siempre de correr el código (cuando se esté usando R) y de tratar de entender todos sus elementos
Consejos para garantizar el máximo aprovechamiento del curso
- Asegurate de tener todo lo que necesitas antes del comienzo de la clase
- Tratá de estar preparado unos minutos antes del comienzo de la clase
- Intentá concentrarte al máximo en el curso, cerrá otros programas o pestañas innecesarias del navegador de internet (por ejemplo, instagram, twitter, etc)
- Comentá el código
